Генеральный директор является единоличным исполнительным органом Ассоциации и осуществляет текущее руководство деятельностью Ассоциации.
Генеральный директор назначается на должность по представлению Совета Ассоциации Общим собранием членов Ассоциации сроком на 7 (семь) лет.
Генеральный директор Ассоциации «МСС» Коноплич Сергей Валерьевич (избран решением Общего собрания членов Ассоциации от 16.12.2020 (Протокол № 25).